液相色譜柱在使用前，進行柱的性能測試，并將結果保存起來，作為今后評價柱性能變化的參考。但要注意：柱性能可能由于所使用的樣品、流動相、柱溫等條件的差異而有所不同；另外，在做柱性能測試時是按照出廠報告中的條件進行，只有這樣，測得的結果才有可比性。
液相色譜柱在使用過程中易出現(xiàn)的問題和解決辦法
在使用中常見的問題就是柱壓升高，如果柱壓是在長時間使用過程中緩慢增加，屬于正常現(xiàn)象。但柱壓在使用過程中突然升高（系統(tǒng)管路堵塞及壓力傳感器故障除外），可能的原因有如下幾點：
(1)柱頭的過濾篩板堵塞或污染；
(2)柱頭的填料被樣品污染；
(3)柱內緩沖液中的鹽遇到高濃度的甲醇或其他有機溶劑，形成結晶析出；
(4)流動相pH值過大或過小使固定相結構破壞或溶解。
解決辦法如下：
(1)如確定是液相色譜柱頭的過濾篩板被污染，可以將反方向用甲醇沖洗至正常壓力，或者卸下柱頭，將其放在10%的稀硝酸內超聲清洗10分鐘，后再用純水超聲10分鐘，重新裝入。
(2)如確定柱頭的填料被污染，將柱頭螺絲卸下，挖出柱內前段被污染的填料，用相同的柱填料重新填入，仔細修復后，重新安裝上柱頭螺絲。
(3)如確定定是鹽結晶，用10%的甲醇/水沖洗色譜柱使柱內鹽全部溶解，再換高濃度甲醇。
(4)如果因pH值使用不當，很難恢復。
